Roux est lauréat de la médaille d'argent du CNRS (1992), du grand prix des matériaux IBM (1993), du grand prix Mergier-Bourdeix de l'Académie des sciences (1995) et du Grand prix de physique appliqué de la société française de physique. . Il a reçu la médaille de l'innovation du CNRS en 2013.
Il est membre de l'Académie des sciences, de l'Académie de technologie et Chevallier de l'Ordre national du mérite.
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