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Les cristallographes s'unissent pour lutter contre le coronavirus

L'Union internationale de cristallographie (IUCr), membre de l'ISC, recueille des histoires du monde entier sur la façon dont les cristallographes contribuent aux efforts visant à trouver un vaccin contre le COVID-19.

Le Site Internet de l'IUCr met en évidence un certain nombre de découvertes clés et fournit des liens vers des ressources disponibles gratuitement pour la recherche sur les coronavirus et COVID-19. Nous soulignons ci-dessous certaines des avancées décrites par l'IUCr :

Au Université du Texas (UT) aux États-Unis, Jason McLellan a utilisé une technologie de pointe connue sous le nom de microscopie électronique cryogénique (cryo-EM) afin de déterminer la structure de la protéine de pointe du coronavirus. Cryo-EM permet aux chercheurs de créer des modèles 3D à l'échelle atomique de structures cellulaires, de molécules et de virus. Après que des scientifiques chinois aient publié la séquence du nouveau coronavirus, le Dr McLellan et son équipe ont conçu une variante de la protéine de pointe pour augmenter sa stabilité et son expression à des fins d'étude, et ont ordonné la synthèse de l'acide nucléique pour la protéine de pointe modifiée. Dans 25 jours de recevoir l'acide nucléique modifié, ils ont cloné le gène, exprimé la protéine, l'ont isolée, ont utilisé l'installation cryo-EM de l'université pour déterminer la structure et ont soumis leur article à Science, où il a déjà été publié.

Structure de la protéine de pointe 2019-nCoV dans la conformation de préfusion

Il s'agit d'une carte à l'échelle atomique 3D, ou structure moléculaire, de la protéine de pointe 2019-nCoV. La protéine prend deux formes différentes, appelées conformations, l'une avant qu'elle n'infecte une cellule hôte et l'autre pendant l'infection. Cette structure représente la protéine avant qu'elle n'infecte une cellule, appelée conformation de préfusion (image reproduite avec l'aimable autorisation de l'Université du Texas à Austin).

Le président sortant de l'IUCr, Marvin Hackert, a utilisé les coordonnées du Dr McLellan pour produire un modèle imprimé en 3D, qui a été présenté par le Dr McLellan sur Fox National News aux États-Unis et sur WXYZ-TV Detroit.

Pendant ce temps, le récent Réunion cristallographique conjointe polono-allemande à Wroclaw, en Pologne, a commencé par une conférence plénière de Rolf Hilgenfeld (Université de Lübeck, Allemagne) intitulée « Du SRAS au MERS et au virus de la pneumonie de Wuhan 2020 – Comment la cristallographie aux rayons X peut aider à combattre les virus émergents ». Des résultats ont été présentés qui n'avaient été obtenus que ce jour-là. Vous pouvez en savoir plus sur ces histoires dans le prochain numéro de la Bulletin de l'UICr, et un certain nombre de ressources supplémentaires sont disponibles sur le Site Internet de l'IUCr, qui est régulièrement mis à jour.

Un numéro virtuel contenant tous les articles et résumés sur les coronavirus publiés dans les revues IUCr est disponible dans une collection à lecture gratuite ici


Photo : Nouveau coronavirus SARS-CoV-2 (NIAID sur Flickr)

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