L'Académie palestinienne des sciences et des technologies a été fondée en 1994 par l'Organisation de libération de la Palestine à la demande de l'UNESCO. Elle a été officiellement créée par le décret présidentiel n° 114 de 1997, qui lui a conféré le statut d'organisation autonome, non gouvernementale et à but non lucratif. Ce décret a conféré à l'Académie le rôle d'instance principale pour les sciences et les technologies dans le pays, avec pour mission de conseiller sur l'élaboration de politiques, de programmes et de projets visant à soutenir le développement national, et de coordonner les activités scientifiques et technologiques pertinentes. De ce fait, l'Académie est devenue le centre névralgique et l'organisation faîtière des sciences et des technologies en Palestine.
Le docteur Fathi Arafat était nommé à la tête de son premier président, avec S.E. Yasser Arafat, président de l'Autorité nationale palestinienne, en qualité de président honoraire.
En 1998, le Dr Rafiq Al-Husseini a été nommé premier secrétaire général de l'Académie. Le Dr Mohamed Ziara lui a succédé comme secrétaire général par intérim en 2000, puis le Dr Imad Al-Khatib début 2001, qui a d'abord occupé le poste de secrétaire général par intérim avant d'être nommé secrétaire général plus tard dans l'année. Le Dr Hikmat Ajjuri a été nommé vice-président de l'Académie.
Le statut de l'Académie a été réaffirmé par Décret présidentiel n° 13 de 2004 (en AnglaisL’Académie palestinienne des sciences et des technologies joue un rôle essentiel dans la promotion des sciences, des technologies et de l’innovation en Palestine, contribuant ainsi à son autonomie en tant qu’institution nationale, indépendante et autogérée. Pour ce faire, elle collabore étroitement avec des partenaires issus du monde universitaire, des pouvoirs publics et de l’industrie, tant au niveau local qu’international. La coordination et l’optimisation des efforts nationaux sont particulièrement cruciales compte tenu des ressources limitées et des défis importants rencontrés. L’Académie a son siège à Jérusalem et des bureaux à Ramallah et à Gaza.
