Dans le cadre de Faire progresser la découverte de médicaments : une série de webinaires des Académies nationales des sciences, de l'ingénierie et de la médecine, une série en deux parties sur l'IA dans la conception de médicaments sera présentée. La séance de 60 minutes comprendra une présentation du Dr Marinka, professeur adjoint à Harvard au département d'informatique biomédicale, sur la découverte de médicaments moléculaires et une séance de questions-réponses.
La première partie de cet atelier présente comment l’IA fait progresser la découverte de médicaments moléculaires. Les grands modèles de langage et l’IA générative transforment profondément la conception des médicaments. La discussion comprend l’apprentissage auto-supervisé, qui utilise de vastes ensembles de données non étiquetés, et l’apprentissage profond géométrique, qui exploite la géométrie et la structure des données biochimiques. Ces approches donnent naissance à des modèles génératifs qui aident à concevoir des molécules utiles en générant des structures moléculaires qui maximisent l'affinité de liaison avec des cibles biologiques, servent de liants optimaux et possèdent des propriétés biochimiques spécifiques. Pour que les médicaments soient efficaces, ils doivent agir sur des cibles biologiques dans des contextes biologiques pertinents. La session décrit PINNACLE, un réseau neuronal graphique qui identifie les contextes cellulaires optimaux pour l'action des médicaments. Les modèles PINNACLE effectuent une série de tâches, notamment l'amélioration des représentations structurelles 3D des protéines essentielles en immuno-oncologie, la prédiction des effets des médicaments dans des contextes de types cellulaires et la désignation de cibles thérapeutiques d'une manière spécifique à chaque type de cellule.
Marinka Zitnik Zitnik est professeure adjointe au département d'informatique biomédicale de Harvard, avec des postes supplémentaires à l'Institut Kempner pour l'étude de l'intelligence naturelle et artificielle de l'Université Harvard, au Broad Institute du MIT et de Harvard, et à Harvard Data Science. Zitnik étudie les fondements de l'IA qui contribuent à la compréhension scientifique de la médecine et de la conception thérapeutique, permettant ainsi à l'IA d'apprendre et d'acquérir des connaissances de manière autonome. Ses recherches ont remporté plusieurs prix, dont celui de la meilleure publication et de la meilleure recherche, dont le prix Kavli. Fellowship Elle a reçu des prix de l'Académie nationale des sciences, des prix de la Société internationale de biologie computationnelle, de la Conférence internationale sur l'apprentissage automatique, du programme Bayer Early Excellence in Science, d'Amazon Faculty Research, de Google Faculty Research, de Roche Alliance with Distinguished Scientists et du prix Sanofi iDEA-iTECH. Elle a fondé Therapeutics Data Commons, une fondation mondiale d'IA ouverte pour faire progresser la science thérapeutique, et est responsable du corps professoral de l'initiative AI4Science.
Ana Ferrera – aferrerasfiel@nas.edu
Photo par Institut national du cancer on Unsplash
