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Le siège de l'ISC est basé à Paris et assure la planification et les opérations quotidiennes sous la direction du conseil d'administration élu. L'ISC dispose de points focaux régionaux dotés de personnel local.
Direction
Science
Le Centre pour l'avenir des sciences
Travailler pour améliorer notre compréhension des problèmes actuels et à venir liés à l'avenir de la science, aux systèmes scientifiques et à la politique scientifique
Liberté et responsabilité en science
Travailler aux intersections entre la science et les droits de l'homme pour défendre et protéger les libertés dont les scientifiques devraient jouir, et les responsabilités qu'ils portent tout en s'engageant dans la pratique scientifique
Unité de la politique scientifique mondiale
Mobiliser l'expertise scientifique et politique dans les processus onusiens et intergouvernementaux